mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGCTGCCAGCATGATCTTG AGGTCATGCTGGTAGTTTCAC CCAGTAGCAGTTAAGCTGCCAGCATGATCTTGTCTTCCTCTCTTAGGTTTCATATATAGTTAATAAATATTTTATATATTTCTTGTTCTTACAAGATTATATGATCATAGCTTAGAGAGAGAGAGAGACTAGGTCATGCTGGTAGTTTCACCTGCTAATG 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR167_1 4e-57 aly-MIR167c 1e-23 -67.1 .((.((((((..((((((((((((((((((.((((..(((((((((((((((((((.........(((((.....)))))((((((....)))))).)))))))....)))))...)))))))..)))).))))))))))))))))))...)))))).)) (-67.10)