mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGTCTTGTATCAACTGAAT TTACCGGCGGTCTCGGATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTGGCTGACACCGACACGTGTCTTGTCATGGTTGGTTTGTGAGCTCCCGTCTTGTATCAACTGAATCGGAGTCCGAGGTGA 3 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR168 6e-65 aly-MIR168b 7e-52 -62.5 (((((..(((.(((.((((((.((((((((((.(((((........(((.((((((((.((((......))))))))))..)).)))))))).)))))))))).)))))).))).))).))))) (-62.50)