mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCAAGGATGACTTGCCG GCAAGTTGACCTTGGCTCTGC GGGTCTTGCATGAAGGAATAACGAATGGAATTGAGCCAAGGATGACTTGCCGGTTTAAACCCAACCGGTTTATGACCATTGATTTGGTCTCATTCACAATCTGTTGATTCGTGTCTGGCAAGTTGACCTTGGCTCTGCTTCGTTCTCTATTCTTCCATGTTAGATTC 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR169_2 1e-66 aly-MIR169f 1e-84 -74.1 ((((((.(((((.(((((((..(((((((...(((((((((.(((((((((((..((((((.....)))))).(((((......))))).....(((((((....)))).))).))))))))))).)))))))))...)))))))..))))))).))))).)))))) (-74.10)