mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTATT TCATATAAGAGAAAATGGTGACATGAAGAATGAGAACTTGTGTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTTTTAGACCATATATATCAAAGACTCACTCGATCGATAGTCTTAGAGTTGGTTGGTCGTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATTCAAACAATTCTCATTCTCTTCATTCACATTTCTCTTTTTTGG 0 2 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR169_5 4e-73 aly-MIR169h 3e-61 -80.5 .((...((((((((...((((.((((((((((((((.((((.(((((((((((((.((((.(((((((.....(((((......((.((((((...((....)).)))))).))..)))))...)).))))))))))))))))))).))).)))))))))))..))))))))))).))))))))...)). (-80.50)