mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGTCAATATC TATTGGCCTGGTTCACTCAGA CGAGAGAGTCCCTCTGATATTGGCCTGGTTCACTCAGATTCTCTTTTACTAACTCATCTGATTGAGCCGTGTCAATATCTCAGTCCTCTCTCG 2 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR171_1 2e-42 aly-MIR170 3e-38 -40.49 ((((((((..(....(((((((((.(((((((.((((((................)))))).))))))).)))))))))...)..)))))))) (-40.49)