mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GTGGCATCATCAAGATTCACA TGCTGTGGCATCATCAAGATTCACATCTGTTGATGGACGGTGGTGATTCACTCTCCACAAAGTTCTCTATGAAAATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCGGC 4 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-172 6e-52 aly-MIR172a 2e-48 -43 .(.((..(((((((((((((((.(((...(((.((((.(((((....))))).)))))))..(((.....))).))).)))))))))))))))..)).)... (-43.00)