mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GCAGCACCATTAAGATTCACA AGGCGCAGCACCATTAAGATTCACATGGAAATTGATAAATACCCTAAATTAGGGTTTTGATATGTATATGAGAATCTTGATGATGCTGCATCAAC 4 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-172 9e-48 aly-MIR172b 4e-37 -36.4 .(..((((((.(((((((((((.((((...((...((((.((((((...))))))))))..))...)))).))))))))))).))))))..)... (-36.40)