mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATCTTGATGATGCTGCAT GCAGCACCATTAAGATTCACA GTAGTCGCAGATGCAGCACCATTAAGATTCACAAGAGATGTGGTTCCCTTTGCTTTCGCCTCTCGATCCGCAGAAAAGGGTTCCTTATCGAGTGGGAATCTTGATGATGCTGCATCAGCAAATAC 2 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-172 1e-65 aly-MIR172e 7e-55 -53.9 ......((.(((((((((.(((((((((((.((...((((.((..((((((((..(((.....)))...)))...)))))..)).))))...)).))))))))))).))))))))).))...... (-53.90)