mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCCATCCTGAGTTTCA GTAGAGAAGAATCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGATGATCACATTCGTTATCTATTTTTTGGCGCTATCCATCCTGAGTTTCATTGGCTCTTCTTACTAC 1 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR390 4e-50 aly-MIR390a 8e-42 -51.6 ((((((((((..(.((.((((((((((.(((((((((((.((((((.((....)).))).)))...))))))))))).)))))))))).)).)..))))))..)))) (-51.60)