mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC GTTCCCTTTAACGCTTCATTG ATGTCCCCATGAGTTCCCTTTAACGCTTCATTGTTAAATACTCAAAGCCACATTGGTTTGTATACAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTCTTGGTGTCAT 3 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-395 1e-43 aly-MIR395b 3e-47 -44.1 (((.(.(((.(((((((((..(((((((((.((((..((((...(((((.....)))))))))..)))).)))))))))..))))))))).))).).))) (-44.10)