mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC GTTCCCTTTAACGCTTCATTG ATGTCCACATGAGTTCCCTTTAACGCTTCATTGTTGAATACTCAAAGCCACATTGGTTTGTATATAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTCTTGGTGTCAT 3 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-395 9e-51 ath-MIR395b 8e-45 -43.8 (((..(((..(((((((((..(((((((((.(((((.((((...(((((.....))))))))).))))).)))))))))..)))))))))...))).))) (-43.80)