mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGAAGTGTTTGGGGGGACTC GTTCCCTTAAACGCTTCATTG ATGTCCCCTTGAGTTCCCTTAAACGCTTCATTGTTCATACTTTGTTATCATCTATCGATCGATCAATCAATCTGATGAACACTGAAGTGTTTGGGGGGACTCTAGGTGACAT 1 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase mir-395 7e-58 aly-MIR395f 8e-33 -54.1 (((((.(((.((((((((((((((((((((.(((((((...(((..((((((....))).)))....)))....))))))).)))))))))))))))))))).))).))))) (-54.10)