mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTT GCTCAAGAAAGCTGTGGGAAA GGTCATACTTTTCCACAGCTTTCTTGAACTTTCTTTTTCATTTCCATTGTTTTTTTCTTAAACAAAAGTAAGAAGAAAAAAAACTTTAAGATTAAGCATTTTGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGAAAACATGACA 1 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR396 1e-44 aly-MIR396b 5e-19 -48 .(((((..(((((((((((((((((((.(((((................(((((((((((........)))))))))))....(((.......)))......))))).)))))))))))))))))))..))))). (-48.00)