mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGAGTTGGGTCTAACCCATAACT TTATGGGTTGACCCAACTCATTT TCAAAATGGGTAACCCAACCCAACCCAACTCATAATCAAATGAGTTTATGATTAAATGAGTTATGGGTTGACCCAACTCATTTTGTTAAATGAGTTGGGTCTAACCCATAACTCATTTCATTTGATGGGTTGAGTTGTTAAATGGGTTAACCATTTA 0 1 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR405 2e-43 ath-MIR405b 1e-56 -79.6 ...((((((.(((((((...((((.(((((((...((((((((...........(((((((((((((((((((((((((((((....)))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))).)))).....))))))).)))))). (-79.60)