mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGAGTTGGGTCTAACCCATAACT TTATGGGTTAGACCCAACTCATTT TTAACCCATTTAACAATTCAACCCATCAAATGAAATGAGTTATGGGTTAGACCCAACTCATTTAACAAAATGAGTTGGGTCTAACCCATAACTCATTTAATTATAAACTCATTTGATTATGAGT 0 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase MIR405 2e-34 ath-MIR405a 1e-56 -59 ...............(((((....(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))...........)))))))))..))))) (-59.00)