mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAAGGTAGTGAATTTGTTCGA AAAACACGTCACTATTTCCTTTAT AAATATATTCAAAAGTGGTCAAAACACGTCACTATTTCCTTTATGTTTTCCCCTTATTGATGGAAATGGTTAAACATGAAGGTAGTGAATTTGTTCGAATAATATGTTGATATATTT 3 5 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 100 -27.8 ((((((((.(((..((..((..((((..((((((...(((((((((((..((...(((......)))))..)))))))))))))))))...)))).))...))...))))))))))) (-27.80)