mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCTCTGTGGTAGCCCTCA AGGGCTCCTCAGGTGTTCATG TAAATTCGTCATGAGCCTCTGTGGTAGCCCTCACAATGATCTCAATAGAGTGCATGCCACGATCTTGTAAAGACGTAGATGAGGGCTCCTCAGGTGTTCATGTCGAATGTTAG 2 1 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 aly-MIR771 5e-37 -45.9 ...(((((.(((((((.((((.((.((((((((..(((..(((....)))..)))...(((.(((.....))))))...)))))))))).)))).))))))).)))))..... (-45.90)