mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGATTCCAGCTTTTGTCTC GGCAATAACTTGAGCAAACA GGTTGAAGGTGGCAATAACCTCAAATATATCAGAGGGTGTAGATACTCAACGACTATAGGAGGCAATAACTTGAGCAAACAATTGATTGCAGAAATCCATCGACTAAAGCTGTCACCTGTTTGATTCCAGCTTTTGTCTCCTTACCTGTTGAGTGTCTAAACTCTCTGGTACGTTCATAGTTGTTGCTGCCTTTCGCT 4 1 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 ath-MIR773 4e-33 -85.2 (((.(((((..((((((((....((..(((((((((((.(((((((((((((.....(((((((((...((.(((((((((..((((.((.....((....)).....)).))))..)))))).))).))...)))))))))....))))))))))))).)))))))))))..))....))))))))..))))).))) (-85.20)