mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTTACCCATATGGCCATC TGGCTGTTTGGGTAACTAATA TCATTTCAGATGGCTGTTTGGGTAACTAATATTTAAGATTTTGGTCAATTTAAGTTACCAATTTATATATTGGTTACCCATATGGCCATCTCAAATTT 1 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 aly-MIR774 3e-16 -40.4 ..((((.((((((((((.((((((((((((((.((((...(((((.(((....)))))))))))).)))))))))))))).)))))))))).)))).. (-40.40)