mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGAGTTTTCTGGATACTTA AGTATCCAGAAAACTCTAAATT TCAAATTAGAGTTTTCTGGATACTTATTAGTTACTAACAAAGAGAGGGCTTCTTCGATATTAACTTTTAAGTATCCAGAAAACTCTAAATTTGA 0 1 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 aly-MIR781 2e-30 -42 ((((((((((((((((((((((((((..(((((.((.(.(((((.....))))).).)).)))))..))))))))))))))))))).))))))) (-42.00)