mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGATTCCCAATCCAAGCAAG TGCTGGGATCGGGAATCGAAA AAGAAAGAAAAAATAAGTGACAAGTAACAAACATGAGAAAGGTGAAACTTGCTGGGATCGGGAATCGAAAGATCCGAAAGCCAGTCTTTAGAGGATTCTGAACGGGCTAGTGAAAGTAAACTTGTGATGTGACCATATTGTGCAATATGAATGTAAGTTGGTGGTGTGGTCATCTCACAAGGTGGCTAAGTCATCTCACTTATTTTCTTAACGAAAGCATCAGCCCGTTTAGCATCATCTTCTTGAAGCTTGCCTTTCGCATCTTTTGATTCCCAATCCAAGCAAGGTTCACCTTTTTTTTTGCCATGACCTTTACAAAATATCCAAATTTTG 2 0 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 ath-MIR832 2e-174 -127.3 ...((((.........((........))...(((((((((((((((.((((((.((((.((((((((((((((.((((((.(((.(((((((((((.(((((((((((...((((((((...(((((.((((((((((..(.((((..........)))))..)))))))))).))))).((((((...))))))....))))))))....(....)....)))))))))))....)))))).))))).))).)))))).)))))))))))))).)))).)))))).)))))))))))......))))..)))).((((((......)))))) (-127.30)