mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTTGTTGTACTCGGTCTAGT TAGACCGATGTCAACAAACAAG GGACGTAGATGGTACTCTTACAGATGGTGATCGTGAAAACAAACGGAGGAGTTTGTTTGTTGTACTCGGTCTAGTTCAAACCAAAACATCTTTGCAAATATGTATGGTTTGAGCTAGACCGATGTCAACAAACAAGCTGCTTCGTTTGTATTCACCATCAACATCTTTAAGAAACGCTGCACCACTC 0 2 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 ath-MIR833 1e-103 -93.7 ((..((((.((....(((((.(((((.((((.(((((.((((((((((.(((((((((((((.((((((((((((((((((((..((((.((....)).)))).)))))))))))))))))).))))))))))))))).)))))))))).))))).)))).))))).)))))..)))))).)).... (-93.70)