mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAACGAACAAAAAACTGATGG CATCAGTTTCTTGTTCGTTTCA TTTTTGATAAATACTTTTGTTTGCTTACAAGTATAAAGTCATCATGTTTTTTTCATCAGTTTCTTGTTCGTTTCAAAATTATGATTTTTGTTTACTTACACTCATAATCTTGAAACGAACAAAAAACTGATGGAAAAACATGAGGACTTTATACTTGTAAATAAATAAAAATATTTATTAGAAA 1 1 3' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 ath-MIR837 3e-89 -86.6 .((((((((((((.(((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((((.(((((((((((((.(((((((....(((......))).))))))).))))))))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))))).))))))))).)))))))))))). (-86.60)