mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACGAGCCACTGGAAACTGAA CAATTTCTAGTGGGTCGTATT TCCTCATCTCCTCTAACCGCCAACTGCAAATGCCTTGGAGTTATCCTCTTCACTTTCAAATCCTTGTTAGTGTTTTCGGCCAACTGAAGAACCTCAGTAGTTAGGCATTCAAGGATTGAAGTCGTGTAGACAACATCAGTCGCACCAACAGTACCATGTGCAGAAACTCTGGTCTTAAGTTGCTTGTGAATACGAGCCACTGGAAACTGAAAGAAACAAAGAAACAATATCAGTATAAAATTTCATCAAATTAGACTACAAAAAATGAAATTTCTTTGTTTATTTCAATTTCTAGTGGGTCGTATTCACATACAACTCAAGACTAGAGTATCTACAACATGGTCTACTTGGTGCTATTGTTGTTGACTACACGCCTTCAATCCTAAAGTGCCTAATTTCATAGGTTATTGAGTTACTTAGAAACACAAGCAATGATAAGAAAATGAAGAGGATTACTCCAATGCATTGATAGTTGGTGATCGCAGGAGATAAGGA 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 ath-MIR841 5e-99 -241.46 ((((.(((((((.....(((((((((..(((((.(((((((.((((((((((.((((..(((.(((((.(((((((..(..((((.((.(((((....(((((((((((..((((((((((.(((((((.(((((.((((.(((((((.((.(((((((..(((.(((((((((((.(((((..(((((((((((.((((((((((.(((((.((((((((((................(((((((..................))))))))))))))))).))))).)))))))))).)))))))))))..))))).))))))))))).)))...)))))))))..))))))).)))).))))).))))))).))))))))))..)))))))))))....))))).)).))))..)..))))))).))))).)))..)))).)))))))))).))))))).)))))..))))))))).....))))))).)))) (-241.46)