mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCGGTTCGCGATCCACAAG TGTGGGTGGCAAACAAAGACG TTTTCTTTCTTTTCCTTTTCGTTTGATTTTGGAAAGCAAGGGACTGTCGTCTCGGTTCGCGATCCACAAGTAATCTTTTGTGGAGATTATGAAAACAATCATCACGAGAGGCTACGTGTGGGTGGCAAACAAAGACGACAATCCCTATTCCAGTTCCATCAGAACTTGAAATATCATGTGAACT 5 0 5' arm Arabidopsis_thaliana mirbase 100 ath-MIR851 6e-84 -68.9 .................((((..((((...........(((((.((((((((..(((.((.(((((((.(((..((((((((..((((.(....).))))..))))))))..))).))))))).)).)))..)))))))).))))).(((.(((((.....))))).)))..))))..)))).. (-68.90)