mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGC GAAGAAGAAGAAGAAGAGAGGCCTCGCATGGCGATGAGAGCTCGCATCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCTCTGCTCATGTGCAGTAGAAGAAGATGCATTTCTAGCTGCTTTCTGCATATGTGATCTCACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGCGGCTCTCATCCTTCATGCCTGGCTCATCTCTTCTTAATGATC TTCTCAGCGAGCTAGCAGCTATAGCTTAGCTGGAGATCGATCGAGAGGTAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAGGCCTCGCATGGCGATGAGAGCTCGCATCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTCTCTGCTCATGTGCAGTAGAAGAAGATGCATTTCTAGCTGCTTTCTGCATATGTGATCTCACAGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCTGAGCGGCTCTCATCCTTCATGCCTGGCTCATCTCTTCTTAATGATCTCTTATTAGTCACAGATCCTGTAGAGATTAGTTGATGTTTGATGCTTGTCCACTTCAGTGCCACACATAAACATAGCGGCCGTGATCAACTGATCAGTCCAGCCTGA 0 2 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR169_5 1e-76 osa-MIR169j 1e-66 -93.7 ..........(((((((((((((..((((((.(((((((((.(((.((.((((((((((((.((((.(((((((..((....(((((((((.((.((.(((......)))..)).))..))))))))).))...))))))))))))))))))))).)).))))))))))))))..))))))..))))..)))))))))....... (-93.7)