mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATACTTCTGTCAATA GGGAGTGATGCAGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACAAGGATATAAGGAAATTCAAGAAAGAGAGGAAAAAAGAGCCTGCATCTTTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCAATACCATTATTTATTCCT 0 1 5' arm Brassica_napus mirbase 100 bol-MIR157a 3e-30 -55.5 ((((((((....(((.((((((((((((((((((((((.(((((.((.((((........((((........)))).........(((.........))))))).))...))))).))))))))))).)))))))))))))).....)))))))) (-55.50)