mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAATGCACTGAAAGTGACTA GTCACTTTCAATGCGTTGATC TTTATTGCTTCGATCAATGCACTGAAAGTGACTACACCAGGATTTGTTTTTAAGTTTTTGCTCTCATCTATATGATAAAGATGAAAATTAGCCTCTGATGTAGTCACTTTCAATGCGTTGATCATAGCATGGAAA 1 0 5' arm Brassica_napus mirbase 100 ath-MIR161 0.000000007 -51.6 (((((.(((..((((((((((.((((((((((((((.((((...........(((....))).((((((.........)))))).........)))).)))))))))))))).))))))))))..)))))))).. (-51.60)