mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC TGGATGATGCTTGGCTCGAGA GAGCCAAAAGTTCAGGTGGATGATGCTTGGCTCGAGACCATTAAATATGATCATTGTGATGTTGATGATGATGATGATAATGATAATGATAGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAACTTACACGTTT 4 0 3' arm Brassica_napus mirbase mir-166 5e-19 bna-MIR166b 5e-19 -41.1 .......(((((.(((.((((((.((((((..(((.(.(((((..(((.(((((..(.((....)).)..))))).)))....))))).)..)))..)))))).)))))).))).)))))........ (-41.10)