mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAAGTTGTCCTTGGCTATA TGTGACCAAAGTAGTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATTTAAAATATCTGATAAGTATTTTATTTCGTATTTTAAAGAAAAAAATCATGATCGGCAAGTTGTCCTTGGCTATACGTTTCTTTGTGTCGCG 3 0 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_2 0.0000000000001 bna-MIR169b 2e-18 -59.6 .((((((((((.((((((.(((((((((..(((((((((((((((((((..((((((...))))))..))))))))..((......))..)))))))))))..))))))))).)))))).))))).))))). (-59.60)