mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAAGTTTTCCTTGGCTACA GTGACCAAAGTAGTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATTTGAAATATATTTTTAATACTTTACTAAGACATCTTTTCAGTTTCAAATTTGTCTTGGAGAGGCTAGGAAGAAATTACAATTTATTTCGTAGTTTAAAGAAAAAATATGATCGGCAAGTTTTCCTTGGCTACATGTTTCTTTGTGTCGC 2 0 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_2 2e-96 bna-MIR169a 3e-18 -71.5 ((((((((((.((..((.(((((((((.((((((((((((......((((((((.........((((((((..(((........)))..))))))))..((((((.((((((((....)))).)))).)))))).....)))))))))))))))))))).))))))))).))..)).))))).))))) (-71.50)