mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCTCCTTGGCTATC AGATGAATAGAAGAATCATATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTATTTCTTGAGAGTAAAATGGGCATGGTGTCATGTTAAAAGTTACTGTAGGTAGTTTCAATTTGACCATTTTCCTTACAAATGATATTAGGCAGTCTCCTTGGCTATCCTTATATGTTCTTCTCTCTCATCT 0 2 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_5 3e-21 ath-MIR169m 1e-29 -67.2 ((((((..(((((((.(((((..((((((((((((.((((.(((((..(((((.(((.((((((((((((....))))).....(..((((....))))..).......))))))).))).)))..))...))))))))))))))))))).))..))))))))))))...)))))) (-67.20)