mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCTCCTTGGCTATC GAAGGAGATGTCAAAGATGAATAGGAGATTTCTATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTACTTCTTTGCGAAGGAAAATGGTCACGGTGTCATGTTTGAAAGTGAATATACATTTTTAAGAGTATATCAATTAGTGACCATTTTGCGTATAAAAAGATATTAGGCAGTCTCCTTGGCTATCCTTATATGTTCTTCTTTCTCATCTCAGACATTTACCTTC 0 2 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_5 1e-18 bna-MIR169f 1e-104 -91.3 ((((((((((((..((((((..((((((....(((..((((((((((((.((((.(((((..(((((.....(.((((((((((((((((.((.((((((((((......)))))))))).))))))).....))))))))))).)......)))))...))))))))))))))))))).))..)))...))))))...))))))..))))))).))))) (-91.30)