mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCTCCTTGGCTATC GTCAAAGATGAATAGGAGAATTCTATTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTACTTCTTTGCGAAGGAAAATGGTCACGGTGTCATGTTTGAAAGTGAATATATATTTATAAGAGTATATCAATTAGTGACCATTTTGCGTATAAAAAGATATTAGGCAGTCTCCTTGGCTATCCTTATATGTTCTTCTTTCTCATCTCAGAC 0 2 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_5 9e-19 bna-MIR169d 9e-105 -79.2 (((..((((((..((((((((..(((..((((((((((((.((((.(((((..(((((.....(.(((((((((((....((((........))))..((((((((....))))))))......))))))))))).)......)))))...))))))))))))))))))).))..))).))))))))...))))))..))) (-79.20)