mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTGC AGGCAGTCTCCTCGGCTATT GAGAAATGGTGACATGAAGAATGAGAAGTTGTGTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCGTCTTAGACCATATCTATCAAAGACTAAAAGATTGATAGTCTTCGATGAATTGGTTAATCGGTAGGCAGTCTCCTCGGCTATTCAGACAGTTCTCTTTCTCCTCATTTCACATTTCTC 1 2 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_5 5e-23 ath-MIR169h 5e-35 -73.9 ((((((((.(((.((((((((.(((((.((((.((((((((.((((.((((.((((((......(((((..((.(((.(((((((.........))))))).)))))..))))).....)))))))))))))).))))).))).))))))))).))))..)))).))))))))))) (-73.90)