mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTGC AGGCAGTCTCCTTGGCTATC AGAGTCATGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCTTTTTCACCTCCATGATTCAATTTTATGTACAGTTTTGGATTACTATGCTTCTAAAGAGTATAGTAATTCAAAATCTTGTTGAATCTTTGAGGGTAACAGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATCTTGACATGCTTT 1 2 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_5 9e-31 aly-MIR169j 8e-40 -76.02 ((((.((((((.((((((((((((.((((.(((((..((.((...((((...((((((((..........(((((((((((((((((((.....)))))))))))))))))))...))))))))...))))..)).))...))))))))))))))))))).)).)))))))))) (-76.02)