mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTGC AGGCAGTCTCCTTGGCTATT GTGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCTTGTTCACCTCCACGATTCAACTTTATACGTTGAAGGGTTTTGGATTATTGTGCATTCAACATGTATAATAATTTGAAATCATGTTGAATCTTTGTGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATTTTGACAT 1 2 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_5 4e-42 bna-MIR169l 1e-91 -71.2 (((((.((((((((((((.((((.(((((..((((...(((..((.((((((((.(((.....)))..(((((..(((((((((((((.....)))))))))))))..)))))..))))))))..))..)))))))...)))))))))))))))))))))..))))) (-71.20)