mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTGC AGGCAGTCTCCTTGGCTATT CATGGCGAAAAGAGTCGTGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCTTGTTCACCTCCACGATTCAACTTTATACGTTGAAGGGTTTTGGATTATTGTGCATTCAACATGTATAATAATTTGAAATCATGTTGAATCTTTGTGGGTTAGGTTTCAGGCAGTCTCCTTGGCTATTTTGACATACTTTTTTCATCCATG 1 2 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_5 5e-51 bna-MIR169j 1e-91 -86.6 (((((.(((((((((.(((((.((((((((((((.((((.(((((..((((...(((..((.((((((((.(((.....)))..(((((..(((((((((((((.....)))))))))))))..)))))..))))))))..))..)))))))...)))))))))))))))))))))..))))))))))))))..))))) (-86.60)