mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCAAAGATGACTTGCCG GCAAGTCGACTTTGGCTCTGT TATATGTATCAGAGAGTCATGCATGGGAAAATAGAGAATGATAATGAGCCAAAGATGACTTGCCGATTTTACCAAAGAATTTAAAACTGATAATGGTGACTGGCAAGTCGACTTTGGCTCTGTTTCCTTCTCTTCTTTTCGATGTAAGACTCTAGATATCTAT 2 0 5' arm Brassica_napus mirbase MIR169_2 0.000000003 ath-MIR169e 1e-29 -68.61 .(((.(((((..((((((.(((((.(((((..((((((.((....(((((((((.((((((((((...((((((...................)))))).)))))))))).)))))))))....)).))))))..))))).))))).)))))).))))).))) (-68.61)