mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTATCCATCCTGAGTTCCA GCGTAGTAGAGAAGTAGCTGTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCATGACTCATCACCATTACTATATGTCTTTGTATATGTAATGGCGCTATCCATCCTGAGTTCCATGGCTTCTTCTTGCTTTTATGT 2 0 5' arm Brassica_napus mirbase MIR390 1e-56 bna-MIR390a 1e-25 -57.4 ((((((..((((((.((((((..(((((((((.((((((((((.(((....)))..((((((((((......))))).))))))))))))))).)))))))))..)))))).))))))....)))))) (-57.40)