mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATC TCATGCGATCTCTTCGGA TCCAAAGGGATCGCATTGATCCTAATCAAGCTGAGTTATTCCCGAATAATTATTTTAATTTTTTCTCAATGGAAAGATAGAAAAAAAAAATTTTGCTTCGTTTTCCGGATCATGCGATCTCTTCGGA 1 1 5' arm Brassica_napus mirbase 100 ath-MIR393b 1e-16 -41.5 (((.((((((((((((.(((((.(((.((((..(((((((....))))))).((((.((((((((.....)))))))).))))...........)))).)))....))))))))))))))))).))) (-41.50)