mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATTTTTGCGTGCAATGATCC ATCATTCACGCAAAAATGATT GGAAGGTGCTGGTTGCTTCACAATTCCAACTCGTCGATTTGCATCATTTTTGCGTGCAATGATCCCGAATTTGCTCTCTTACTCAACTTTCTTTTTAATTTACAAATATTCATGTTTATTGGTTTGAAAAATAGAAAAAAAAATTCTAATTTTTGTTAACGGGGATCTGGATCATTCACGCAAAAATGATTTGACTCGTGAGTTGGCCTTGTGAAGAGACCAGTGCTATCA GGAAGGTGCTGGTTGCTTCACAATTCCAACTCGTCGATTTGCATCATTTTTGCGTGCAATGATCCCGAATTTGCTCTCTTACTCAACTTTCTTTTTAATTTACAAATATTCATGTTTATTGGTTTGAAAAATAGAAAAAAAAATTCTAATTTTTGTTAACGGGGATCTGGATCATTCACGCAAAAATGATTTGACTCGTGAGTTGGCCTTGTGAAGAGACCAGTGCTATCAATAGGAGGGATTTGTTCCCTTCTTTATGGCTTTTAAGAACTATTTCTGTGATAAATTTAAGAGACTGATCATCAATTTTCTTGGTTTTAAGTGGATCAGTCACGATAGTGAATTCCCAGGAAGAATAATTTTGTCTGTGGTAAAGGCTTGGAAAAGAAATTTTGTATTTATTATGCATAAAGAGCCGAAAGTTTCCGGGACAACAAATGGGAAAAGTACTTTGAATTTCTCCAGTCCGGCAACAATCAAGCCCCAGTGAGACCAGAGATACCAACCACATCCCTCTGGTTAGTTAGCGAAAAATGAATTCATTTGAAGGTTTTGAAAACTAGCATCGGGGATTTTGTAACATTTACTCTGGATTAGTTTTACTGATTCCGAGCAAAAATAAGGTCTAGGCGTTTTTCTTAGATTTCAGAGTGAATTAAACGTCGCTGAAGATTACATCACCTTCAGAACCATAGGTGACAGTATTTATACATTATACATTATATGACGTTCAGACTATACAATTAACATTGCTTGAAAAAA 0 1 5' arm Citrus_sinensis mirnest 100 csi-MIR1515 2e-75 -80.8 .((.((((((((((.((((((((..((((((((.(((.(((.((((((((((((((.((((((((.((.....((((.(((..(((.((((...(((((..(((........)))..)))))...))))..(((((.......)))))....))).))).)))).)).)))))))))))))))))))))).))).)))))))))))..)))))))).)))))))))).)). (-80.8)