mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATACTTCTGTCACCA GTGATGCTGGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATATGTATGTATCATCACACCGCCTGTGGATGATTACAAAAATAGCCTGCATGTCTACTCTTTCGTGCTCTCTATACTTCTGTCACCACCATTAT 2 1 5' arm Brassica_rapa mirbase 100 bna-MIR156b 1e-50 -67.6 ((((((.((((....(((((((((((((((((((.(((((.((((((((.((...(((...(((((((((.(((.....)))))))).))))...))))).))))))))...))))).))))))))))).)))))))))))).)))))) (-67.60)