mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATCACG AGATATTAGTGCGGTTCAATC TGGTCAAGCGAGATATTAGTGCGGTTCAATCAAATAGTCTCACTCTTAGTTGATAGAGATTGATTTTGTTCGATTGAGCCGTGCCAATATCACGCATATAACCA 4 0 3' arm Brassica_rapa mirbase MIR171_1 6.0E-15 bna-MIR171a 2.0E-54 -41.8 .(((...(((.((((((.(..((((((((((.(((((..(((.((((........)))).)))..))))).))))))))))..).)))))).))).....))). (-41.80)