mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTGAGCCTTCATGGCTAAG TAGCCAAGAATGGCTTGCCTATC AAACTTGTGAGGAGGGTAGCCTTACATGGAGATGAGGAGATTGCCTCTGTTAGCCAAGAATGGCTTGCCTATCTCCACTATTTGGTTCATCACTGGAACACACTTGGGGTTCTCCGATGGTGGATGAAATATGGAAGATGGTGAGCCTTCATGGCTAAGAGAGTGATTCTCATCCCCCATGCTAGGCTGTATCCCTCTTTCTAGCT AAAGCAATTAAGGGCAGTTAATTAAGCAGAGTAAACTTGTGAGGAGGGTAGCCTTACATGGAGATGAGGAGATTGCCTCTGTTAGCCAAGAATGGCTTGCCTATCTCCACTATTTGGTTCATCACTGGAACACACTTGGGGTTCTCCGATGGTGGATGAAATATGGAAGATGGTGAGCCTTCATGGCTAAGAGAGTGATTCTCATCCCCCATGCTAGGCTGTATCCCTCTTTCTAGCTCTCAACATCTCGCGATCTTCGGTAGGTGATTCTTTCAGTTCTTTGATCTAATTCTAGGTAAGATTCCATTCTTCAGATCATCCATCACAAATTCAGAGGGTATGGTGTGAAGAATTAAGGTGATAGGGGAAGTACAGAAAGGCTTGAAATGCAAGCTGAAAAGGAACAGTGATATGTTCTTGAAAAGATGGAACTGCTCAACTCCTCATTTGTTTCTCCTTCTCCTAAGCTGTGGAATATGGTGTTGTCATTGCATCAAACCA 2 2 3' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR1430 6e-72 -81.8 ....(((.((((((((((((((..(((((.((((((((......((((.(((((((.(((.((((((((.(((((((.(((((.((((((((.((((..((.......))..)))).)))))))).)))))))).))))))))))))))).))))))).))))...))))))))..)))))..))))))...)))))))).))).. (-81.8)