mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATGCTTCTGTCATCA TGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATGTGCAATGACTTTTTCTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTC 1 1 5' arm Ricinus_communis mirbase 100 ptc-MIR156j 1e-28 -45.7 ...((.(((((((((((((((((((((((.(((((.(((((...........))))).))).)).)))))))))))))).))))))))).))..... (-45.70)