mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG GAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTTGATGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGCCCTATAAGCAGAGATTATAATTTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTTGTATTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCT 3 0 3' arm Ricinus_communis mirbase MIR159 3e-98 ptc-MIR159b 5e-32 -85.6 ..((((((((((((..(((((((..((((((((....((((((...(((((.(((((.((((.(..((((((.(((((...(((((.......))))).))))).))))))..).)))).))))).)))))..))))))......))))))))..)))))))..)))))))))))).... (-85.60)