mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCATGCAAGGAGCCATGCATG TTGTGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGTGAAGTTCATCAGAAGCTTGGTGGTCTCCGCAGATGGCATGCAAGGAGCCATGCATGCTGCT 2 0 5' arm Ricinus_communis mirbase mir-160 2.0E-42 vvi-MIR160d 7.0E-11 -55.4 ..((((((.(((((((.(((((((((((((((.((..((((((....))))))..)).))))))))))))))).))))))).)))))).... (-55.40)