mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATCACG GGATATTGGTCCGGTTCAATA AAACGGGATATTGGTCCGGTTCAATAAGAAAACAGTGCTCAAAATGTTATGGGCCCTGCTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTGCAC 3 0 3' arm Ricinus_communis mirbase MIR171_1 5e-46 gma-MIR171a 3e-25 -42.5 ..(((.((((((((..(((((((((.(((((.(((.(((((........))))).))).))))).)))))))))..)))))))).))).... (-42.50)