mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATC TGTTGGCCCGGTTCACTCAGA TGTGATGTTGGCCCGGTTCACTCAGACAAAAACGATGTGTTTTCTCAAGCATTTGTTTTTCGAAACGCTTGATATGTTAACACAAGCATAATGGCCTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCTTAGT 2 0 3' arm Ricinus_communis mirbase MIR171_1 6e-65 zma-MIR171e 0.0000001 -43.4 ...(((((((((.(((((((.(((((.........((((((..(((((((.((((.....))))..))))))...)..)))))).((......)).))))).))))))).)))))))))..... (-43.40)